Профилактика гастроэнтерита у собак заключается в регулярном проведении профилактических обработок, таких как ежегодная вакцинация и обработка от гельминтов (не реже чем 1 раз в 3 месяца), качественное полнорационное питание собаки, исключение возможности поглощения инородных предметов и регулярное диспансерное обследование животного, для своевременного выявления проблем со здоровьем.