Для птиц, которые страдают кокцидиозом, используют препараты Кокципродин, Байкокс (толтразурил).
Байкокс 2,5% (1 мл на 1 л) разбавляется в воде и порой оказывается очень эффективным средством. Тем не менее, для получения максимальной эффективности, важно применить препарат быстро, при первых признаках кокцидиоза. Кокципродин разводится в питьевой воде из расчета 1 мл чистого препарата на 1 л воды. Лечение длится на протяжении двух дней, при тяжелой форме заболевания процедуру необходимо повторить через 5 дней тем же двухдневным курсом.
Также для повышения резистентности организма птицы применять с кормом Премикс профи Бройлер 2,5% (2,5 г на 1 кг корма) или Премикс профи Универсал с расчёта 6 г на 10 голов.
Поскольку низкие температуры и другие воздействия окружающей среды практически не влияют на кокцидии, необходимо прожигание рабочего инвентаря, стен паяльником. Традиционные методы обработки, представленные марганцовкой, растворами формалина, различные эмульсии и щелочи не оказывают должного губительного воздействия на возбудителя. Также необходимо содержать подстилку сухой. Особенно остро стоит вопрос в тёплое время года после дождя, так как это наиболее подходящий период для размножения.
Качественная пища, добавление поваренной соли, ракушки позволят предупредить заболевание. Также практикуется вакцинация препаратами против кокцидиоза. Хороший иммунитет крайне важен для обычных цыплят, но не для бройлеров, так как по истечении 6–8-месячного периода их обычно реализуют. Поэтому их вакцинация не пользуется особой популярностью, так как иногда это приводит к уменьшению общей массы и развитию пигментации.