После заражения кошки выступают как промежуточные хозяева, тяжесть клинического течения заболевания может быть разной. Тем не менее, чаще всего отмечают: повышение температуры (от 40 до 41°С), вялость, одышку, увеличение лимфатических узлов, рвоту, диарею, желтуху, поражение дыхательных путей, неврологические признаки (ступор, атаксия, судороги, частичная или полная слепота и др.), заболевания глаз (передний увеит и т.д.).
Следует отметить, что при токсоплазмозе заболевания глаз развиваются чаще всего по сравнению с другими сопутствующими признаками. Предполагается, что это связано с циркуляцией иммунных комплексов, которые играют важную роль в развитии офтальмологических симптомов, в результате чего могут проявляться без системных клинических признаков заболевания.
Все вышеперечисленные клинические признаки могут сохраняться в течение нескольких дней и даже до нескольких месяцев. Теоретически, может быть поражен любой орган, таким образом клинические признаки очень изменчивы. Центральная нервная система поражается у кошек сравнительно редко. Проведенные гистологические исследования показали, что доля таких кошек составляет лишь 7%. При наличии сопутствующего заболевания (преимущественно вирусный иммунодефицит кошек или инфекционный перитонит) токсоплазмоз протекает тяжелее.
Эпизоотологические исследования показали, что клинический токсоплазмоз наиболее распространен среди взрослых бездомных (бродячих) кошек, а также у домашних кошек, питающихся грызунами (мышами и крысами). Такая статистика объясняется более высоким риском инфицирования и не зависит от возраста и пола кошки. Кроме того, токсоплазмоз тяжелее протекает у котят, приобретших инфекцию внутриутробно, в этом случае заболевание может быть летальным.
Наиболее типичными клиническими признаками у котят являются анорексия, вялость и внезапная смерть. На вскрытии чаще всего регистрируют гепатит (более 75% печени разрушается в результате токсоплазменной инфекции), поражение легких (диффузный отек, истечение из носа). Описаны случаи, когда у котят развивается энцефалит, животные могут непрерывно спать, они могут иметь признаки гиперестезии или нарушения координации. В результате котята не способны питаться и умирают в течение нескольких дней.