Инкубационный период длится от 2 до 14 дней. Обычно болезнь проявляется внезапным угнетением животного, повышением температуры тела до 40-41°С, рвотой и жидким стулом. Рвотные массы сначала водянисто-желтые или коричневатые, позже становятся слизистыми, часто с примесью крови. Одновременно или через короткое время развивается понос. Фекалии жидкие, зловонные, бесцветные, желтые с примесью крови, иногда с хлопьями фибрина. Эти признаки являются следствием катарального или геморрагического воспаления желудка и кишечника.

В условиях острого течения болезни состояние животного резко ухудшается, его температура быстро повышается до 40 °С и выше. Кошки отказываются от корма. Возникает рвота; рвотные массы имеют зеленовато-желтый цвет, содержат слизь, иногда кровь. Моча кошек становится темно-желтой. Фекалии становятся редкими и зловонными, часто с примесью крови и слизи. Они содержат огромное количество вирусов. Слизистая ротовой полости кошек становится сухой и синюшной.

При сверхостром течении панлейкопении происходит внезапная смерть кошки. При легком течении кошки испытывают только недомогание, а болезнь проявляется только при исследовании крови. Острая форма заболевания протекает 1-10 дней. Болезнь очень опасна: среди котят смертность достигает 90%. Кошки, пережившие первые 3-4 дня, обычно выздоравливают, но остаются носителями вируса, т.е. выделяют вирус во внешнюю среду.